Науковий відділ університету забезпечує організацію науково-дослідної роботи науково-педагогічного колективу, яка є обов’язковою складовою його діяльності поряд із навчальною, методичною, організаційною та виховною роботою.

Основні функції наукового відділу такі:

• складання загального плану науково-дослідної роботи МЄУ на поточний навчальний рік на основі відповідних планів кафедр;
• вироблення оптимальної структури планування та ефективних форм науково-дослідної роботи кафедр та інститутів у цілому;
• координація та узгодження діяльності кафедр щодо реалізації ними планів НДР;
• поточний контроль виконання кафедрами планів їхньої наукової роботи;
• узагальнення та аналіз результатів науково-дослідної роботи інститутів за підсумками навчального року;
• підготування аналітичних довідок про стан наукової роботи МЄУ на вимогу ректорату і Вченої ради;
• відслідковування зовнішньої наукової інформації про проведення іншими ЗВО і науковими установами конференцій, семінарів, круглих столів та інших заходів і оперативне доведення цих відомостей до директорів інститутів і завідувачів кафедр;
• збирання інформації в мережі Інтернет та її накопичення;
• підготування проєктів нормативних документів (наказів, розпоряджень), що регулюють науково-дослідну роботу в МЄУ, та доведення їх змісту до відома директорів інститутів та завідувачів кафедр;
• створення електронної версії бази даних науковців МЄУ;
• виконання підготовчої роботи до проведення науково-практичних конференцій, олімпіад, конкурсів, семінарів, конгресів тощо;
• координація участі співробітників МЄУ у міжвузівських, всеукраїнських та міжнародних наукових заходах;
• координація роботи інститутів МЄУ в питаннях планування та проведення студентських наукових конференцій, конкурсів, гуртків;
• співпраця з органами студентського наукового товариства університету, надання їм наукової та методичної допомоги.

Науковий відділ координує роботу науково-дослідних центрів, що функціонують в університеті, та надає їм підтримку.